Top.Mail.Ru

Льготная ставка УСН в Пермском крае: как отменили доначисление 1,45 млн рублей

19.10.2026
Региональные льготы по упрощённой системе налогообложения позволяют законно снизить налоговую нагрузку. Однако применение пониженной ставки нередко привлекает внимание ФНС — особенно если компания входит в группу, зарегистрирована после реорганизации или ведёт деятельность сразу в нескольких регионах.
В одном из наших проектов налоговая инспекция оспорила право транспортной компании на льготную ставку УСН за 2024 год. Компании доначислили 1 455 489 рублей налога и заявили о штрафных санкциях в размере 40%.
Мы разработали стратегию защиты, восстановили и систематизировали документы, подготовили возражения на акт проверки и представили позицию клиента при рассмотрении материалов.
В результате инспекция отказалась привлекать компанию к налоговой ответственности. Доначисления и штраф были отменены.

О компании и применённой налоговой льготе

Наш клиент — транспортная компания, созданная в результате реорганизации в 2023 году. Организация являлась дочерней компанией московского юридического лица и была зарегистрирована в Пермском крае.
На момент регистрации в регионе действовал Закон Пермского края от 1 апреля 2015 года № 466-ПК. Для организаций и индивидуальных предпринимателей, впервые зарегистрированных после 1 января 2022 года и применяющих УСН с объектом «Доходы», закон предусматривал пониженные ставки:
  • 1% — в течение первого налогового периода;
  • 2% — в течение второго налогового периода;
  • 4% — в течение третьего налогового периода.
В 2023 году компания подала декларацию по УСН со ставкой 1%. Камеральная проверка завершилась без нарушений, а применение региональной льготы не вызвало претензий со стороны налогового органа.
В 2024 году компания продолжила применять предусмотренную законом льготу. Поскольку это был второй налоговый период после регистрации, налог рассчитывался по ставке 2%.

Почему возникли претензии ФНС

В 2025 году инспекция проверила декларацию компании за 2024 год и усомнилась в правомерности применения пониженной ставки.
По результатам проверки был составлен акт и доначислено 1 455 489 рублей налога. Кроме того, инспекция заявила о применении штрафа в размере 40%.
Основные доводы налогового органа сводились к следующему:
  • транспортная деятельность непосредственно в Перми не осуществлялась;
  • у компании отсутствовали зарегистрированные в регионе кассовые аппараты;
  • транспортные средства не передвигались по территории Перми;
  • среди контрагентов отсутствовали организации из Пермского края;
  • пермская и московская компании являлись взаимозависимыми лицами.
По существу, инспекция поставила под сомнение реальность присутствия организации в регионе и экономическую обоснованность её регистрации. В акте также просматривались признаки претензий, связанных с возможным дроблением бизнеса, хотя прямое обвинение сформулировано не было.
Для собственника ситуация выглядела крайне серьёзной. Помимо доначисления за один налоговый период, возникал риск пересмотра налоговых обязательств компании за другие периоды и дальнейшего развития претензий к группе организаций.

Почему регистрация в льготном регионе вызывает вопросы налоговой

Региональные ставки УСН устанавливаются субъектами Российской Федерации. Их применение зависит не только от выбранного налогового режима, но и от условий конкретного регионального закона.
При проверке ФНС может анализировать:
  • где фактически принимаются управленческие решения;
  • где находятся сотрудники, имущество и транспорт;
  • по какому адресу хранятся документы;
  • где заключаются и исполняются договоры;
  • в каком регионе находятся клиенты и контрагенты;
  • обладает ли региональная компания самостоятельностью;
  • чем экономически обусловлена регистрация организации;
  • не создана ли компания исключительно ради снижения налогов.
Однако отдельные признаки сами по себе ещё не доказывают совершение налогового правонарушения. Инспекция должна оценивать все обстоятельства в совокупности и подтверждать свои выводы надлежащими доказательствами.
В рассматриваемом деле налоговый орган сделал акцент на территориальных и организационных признаках, но этого оказалось недостаточно для привлечения компании к ответственности.

Как мы выстроили защиту

После получения материалов проверки наша команда взяла ситуацию под контроль. Работа велась одновременно по юридическому, документальному и доказательственному направлениям.

Разработали стратегию защиты

Сначала мы проанализировали:
  • условия региональной льготы;
  • историю создания и регистрации компании;
  • декларации за 2023 и 2024 годы;
  • результаты предыдущей камеральной проверки;
  • отношения с московской организацией;
  • фактическую модель ведения деятельности;
  • аргументы и доказательства, приведённые инспекцией.
Важно было отделить обстоятельства, имеющие юридическое значение, от предположений налогового органа.
Мы сформировали позицию, объясняющую правомерность применения льготной ставки и отсутствие состава налогового правонарушения.

Привели в порядок документацию

В налоговом споре недостаточно заявить, что компания действовала добросовестно. Каждый значимый довод необходимо подтвердить документами.
Мы систематизировали документацию клиента, проверили взаимосвязь договоров, деклараций, регистрационных сведений и других материалов. Это позволило устранить внутренние противоречия и представить инспекции последовательную картину деятельности компании.

Подготовили возражения на акт проверки

В письменных возражениях мы подробно разобрали позицию ФНС и указали, почему перечисленные инспекцией обстоятельства не доказывают неправомерность применения ставки.
В частности, защита была построена на следующих положениях:
  • компания соответствовала предусмотренным законом формальным условиям применения ставки;
  • использование льготы в предыдущем периоде уже проходило камеральную проверку;
  • взаимозависимость организаций сама по себе не является налоговым нарушением;
  • отсутствие контрагентов или кассовой техники в конкретном городе не позволяет автоматически признать льготу неправомерной;
  • инспекция не доказала создание формального документооборота;
  • в материалах не было достаточных доказательств искусственного разделения бизнеса;
  • налоговая экономия сама по себе не подтверждает получение необоснованной налоговой выгоды.
Мы не ограничились возражением против отдельных формулировок акта, а последовательно показали недостаточность всей доказательственной конструкции инспекции.

Дополнительные мероприятия налогового контроля

После получения возражений налоговая инспекция назначила дополнительные мероприятия налогового контроля.
Для компании это означало, что спор ещё не завершён. Инспекция могла запросить новые документы, получить дополнительные сведения и попытаться усилить первоначальную позицию.
Для нас дополнительная проверка стала возможностью:
  • представить недостающие пояснения;
  • уточнить фактические обстоятельства;
  • дополнить доказательственную базу;
  • устранить риск неоднозначного толкования документов;
  • подготовиться к очному рассмотрению материалов.
К моменту рассмотрения дела позиция клиента была подтверждена документами и выстроена в единую аргументированную систему.

Результат рассмотрения: компания освобождена от ответственности

При очном рассмотрении материалов проверки мы представили позицию клиента и ответили на доводы налогового органа.
В результате инспекция приняла решение об отказе в привлечении компании к ответственности за совершение налогового правонарушения.
Доначисление в размере 1 455 489 рублей и штрафные санкции были отменены.
Компания сохранила право на применение льготной ставки УСН за проверяемый период и избежала дальнейшего обжалования в вышестоящем налоговом органе или суде.

Уточнённая декларация не изменила исход дела

Во время рассмотрения материалов проверки клиент самостоятельно подал уточнённую декларацию по УСН за 2024 год. Целью было исправление незначительной технической ошибки.
Обычно подача уточнённой декларации во время налогового спора требует осторожности. Она может повлечь новую камеральную проверку и предоставить инспекции дополнительную возможность запросить документы.
Тем не менее подготовленные возражения и собранные доказательства подтвердили правомерность применения льготной ставки. Камеральная проверка уточнённой декларации была завершена без выявления нарушений.
Таким образом, компания получила положительный результат как по первоначальной проверке, так и по уточнённой декларации.

Что показывает этот налоговый спор

Этот кейс не означает, что для применения региональной льготы достаточно формально зарегистрировать компанию в субъекте РФ.
ФНС обращает внимание на фактическую деятельность налогоплательщика в регионе. Если организация зарегистрирована по льготному адресу, но все сотрудники, имущество, управление и деловые операции находятся в другом субъекте, риск проверки существенно возрастает.
Однако налоговый орган также не вправе отменять льготу только на основании отдельных косвенных признаков. В каждом споре необходимо установить:
  1. Какие условия были предусмотрены региональным законом в проверяемом периоде.
  2. Соответствовал ли налогоплательщик этим условиям.
  3. Какие доказательства собрала инспекция.
  4. Подтверждают ли они искусственное перемещение бизнеса.
  5. Есть ли признаки дробления или формального документооборота.
  6. Обоснован ли размер доначисления и штрафа.
  7. Соблюдена ли процедура проведения проверки.
Результат зависит от совокупности обстоятельств и качества подготовленной доказательственной базы.

Как снизить риски при применении региональной ставки УСН

До подачи декларации по пониженной ставке рекомендуется проверить:
  • актуальную редакцию регионального закона;
  • дату регистрации организации или ИП;
  • выбранный объект налогообложения;
  • продолжительность применения льготной ставки;
  • требования к видам деятельности и структуре доходов;
  • наличие фактической деятельности в регионе;
  • деловую цель регистрации или реорганизации;
  • самостоятельность организации внутри группы компаний;
  • соответствие деклараций, договоров и первичных документов;
  • наличие доказательств реального ведения бизнеса.
Если компания входит в группу взаимозависимых лиц, необходимо отдельно проверить распределение сотрудников, клиентов, имущества, финансовых потоков и управленческих функций.

Что делать после получения акта проверки

Акт налоговой проверки ещё не является окончательным решением. На этом этапе компания может представить возражения и добиться пересмотра выводов инспекции.
Рекомендуемый порядок действий:
  1. Зафиксировать срок подачи возражений.
  2. Получить и изучить все материалы проверки.
  3. Проверить условия региональной льготы в нужной редакции.
  4. Сопоставить каждый довод инспекции с имеющимися доказательствами.
  5. Подготовить документы, подтверждающие реальность деятельности.
  6. Проанализировать риски взаимозависимости и дробления бизнеса.
  7. Подать мотивированные письменные возражения.
  8. Принять участие в рассмотрении материалов проверки.
Не стоит подавать уточнённую декларацию или дополнительные пояснения без предварительной оценки последствий. Даже исправление технической ошибки может повлиять на ход проверки.
•задать вопрос
ПОДГОТОВЬТЕСЬ К ВЫЗОВУ В ФНС
РАССКАЖИТЕ О ВАШЕЙ СИТУАЦИИ
Пришлите уведомление или повестку из налоговой. Мы проверим основание вызова, оценим риски и поможем подготовиться к вопросам инспектора.
— разберём, куда и в каком качестве вас вызывают
— проверим отчёты маркетплейсов и налоговый расчёт
— подготовим позицию для комиссии или допроса
•Вопросы и ответы
Частые вопросы по контрагентам
Да, если она соответствует условиям регионального законодательства, действовавшим в соответствующем налоговом периоде. Необходимо учитывать дату регистрации, объект налогообложения, вид деятельности и другие предусмотренные законом требования.